Mappingのツールだと何かとお世話になるSAMtoolsをコンパイルしよとしたら意外に一発でコンパイルできなかったのでメモを残しておきます。 環境 Ubuntu 11.10 SAMtools 0.1.18 準備 Ubuntuに最初から入ってないものを幾つか使うようなのでそれのために予め以…

BLAST+の簡単な使い方のメモ 環境 BLAST+ 2.2.25 databaseの作り方 makeblastdb -in db.fasta -dbtype prot -out blast.db.fasta 相同性検索 blastp -query query.fasta -db blast.db.fasta -out output 今後の予定 BLAST無印で指定していたオプションがどれ…

EclipseのEGitでSSHを使ってリポジトリのクローンを作ろうとしたら、OpenSSHで作ったprivate keyのパスフレーズが通らなくて困ったときのメモ。 環境 OS:Ubuntu 11.10 OpenSSH 5.8 Eclipse 3.7 解決方法 どうやらEclipseのSSH2でAES暗号が使えないらしい。な…